Muhtasari
Mnamo 2065, Dunia iko katikati ya vita na wageni wa ziada wanaoitwa Nova. Vikosi vya jeshi huendeleza na kufundisha Pandoras, binti ambao wanaweza kutumia tishu maalum za maumbile iitwayo Stigmata (Seikon) Kuonyesha mifumo na ustadi wa kijeshi wa kijeshi. Kusaidia Pandora ni washirika wa kiume wanaoitwa Limiters, ambao hutumia nguvu fulani za "kufungia" kuzuia uhuru wa mashindano yao.
Yoyote ya vizuizi hivi ni Kazuya Aoi, ambaye dada yake marehemu alikuwa Pandora. Kazuya hukutana na Pandora mwenye nguvu, Satellizer el Bridget, aliyepewa jina la Malkia asiyeweza kuguswa, kwa mtindo wake mgumu na upephobia wake uliokithiri wakati akihudhuria Chuo cha Magharibi cha Jenetiki huko Japani. Licha ya onyo kutoka kwa wanafunzi wenzake ili kujiepusha na Satellizer, yeye ni rafiki wa Kazuya, na anaomba kuwa Kikomo chake. Satellizer anakubali kushirikiana naye, ingawa hivi karibuni anaangukia kwenye mashindano ya mapenzi anayeitwa Rana Linchen, ambaye anaamini Kazuya ni mwenzi wake wa roho baada ya kumsaidia kupitia mapigano kadhaa dhidi ya wapinzani wa vyuo vikuu vya nafasi na kozi zinazobadilika. Wakati Novas wanashambulia chuo chao kinachotumia Pandora zilizo chini ya udhibiti wao kupata ufikiaji wa maabara ya chini ya ardhi ya taasisi hiyo, mashindano yao huondolewa.
Satellizer na Kazuya wanajiunga na wanafunzi wachache wa maumbile ya Magharibi katika maabara huko Alaska, ambapo wanaweza kusaidia pamoja na Evolution Pandora (E Pandora) kazi, kuruhusu wanawake wa kawaida kupata upandikizaji wa Stigmata kuwa Pandoras. Wakati mmoja kati ya E Pandoras anapiga kelele, wengine hutoa ikiwa dawa katika jaribio sio hatari, lakini zinafanywa kutii matakwa ya shirika la biashara na vile vile meneja. Baada ya kugundua kuwa hadi zitumike, zitatumika, E-Pandora Amelia Evans anaelekeza uasi ambao unakua kamili kwenye Nova Clash.
Kazuya anajifunza zaidi juu ya viungo vya familia yake kwa Nova na vile vile Pandora. Babu ya Kazuya Gengo Aoi alipata kazi hiyo hiyo, ambayo inaweka Rana na Satellizer katika timu ya kipekee na wanawake wanaoitwa Valkyries. Walakini, wakati wa shughuli zote za maandamano na Nova iliyoundwa maalum ambayo ni dummy, udanganyifu hupatikana na Pandoras, na vile vile densi za Novas zinakuwa kikosi cha 100 cha Nova ambacho kinamaliza Maumbile. Gengo anapinga hii kwa kufungua Pandora za Hadithi ambao ni shangazi wa Kazuya. Jaribio la Chevalier kumuua Gengo akiajiri wafungwa kadhaa walioitwa Busters, wakati Pandora kadhaa za hadithi zinabadilika kuwa Novas mbaya, lakini zoezi hilo linaanguka.