(Yuuki Homura)

Katika siku za usoni, wahandisi wa wanasayansi wa Kijapani exoskeleton yenye nguvu inayoitwa "Infinite Stratos" (IS). Ukiwa na teknolojia na uwezo wa kupambana na hali ya juu zaidi kuliko mfumo mwingine wowote wa silaha, IS inatishia kuyumbisha ulimwengu. Wakikabiliwa na silaha kubwa kama hiyo, mataifa ya ulimwengu yanatunga "Mkataba wa Alaska", ambayo inasema kwamba IS haitatumika kamwe kwa mapigano ya kijeshi na kwamba teknolojia iliyopo ya IS inapaswa kusambazwa kwa usawa kwa mataifa yote, kuzuia taifa lolote moja kwa kutawala wale wengine. Kuanzishwa kwa IS kuna athari kubwa kwa jamii. Kama IS inaweza tu kuendeshwa na wanawake, usawa wa nguvu kati ya wanaume na wanawake umevunjika, na wanawake wanakuja kutawala jamii juu ya wanaume.
Miaka kumi baada ya IS ya kwanza kuletwa, ulimwengu umeingia katika enzi mpya ya amani. Amani imevunjika, hata hivyo, na ugunduzi usiyotarajiwa. Kijana wa miaka 15 wa Kijapani, anayeitwa Ichika Orimura, hugunduliwa kuwa na uwezo wa kuendesha IS. Kutambua uwezo huo, Ichika analazimishwa na serikali ya Japani kuhudhuria Chuo cha kifahari cha Infinite Stratos Academy, chuo cha kimataifa ambacho marubani wa IS kutoka kote ulimwenguni wamefundishwa. Kwa hivyo maisha yake ya shule yenye shughuli nyingi yaliyozungukwa na wasichana huanza.